본 발명의 항균 폴리카보네이트 복합 소재는 폴리카보네이트 100중량부; 나노 금속 산화물 0.01-5중량부; 실리콘 함유 고분자 중합체 0.01-5중량부;를 포함하여 구성되며, 항균 폴리카보네이트 복합 소재의 총중량을 기준으로 은이온의 함량은 100-1200ppm이다. 본 발명은 나노 산화물과 실리콘 함유 고분자 중합체의 분산 및 이동을 상승시켜 은이온이 소재 내부에서 외부 표면으로 농도가 구배에 따라 증가되고, 소재 표면의 은이온 항균제가 마모되면 소재 내부의 은이온이 실리콘 함유 고분자 중합체와 함께 균일한 속도로 표면으로 이동하여 지속적인 항균 효과를 구현하므로 은이온의 첨가량을 줄일 수 있고, 외관이 이쁘고 색상 안정성 및 항균 성능이 우수한 등 장점을 갖는다.