본 발명은 단세포 기반의 암 유전체 분석 자동화 장치 및 방법에 관한 것으로서, 게놈 분석을 수행하는 분석 파이프라인들의 실행을 자동화하여 사용자들이 분석 작업을 효율적으로 수행할 수 있게 하고, 또한 분석 결과를 웹상에서 GUI를 통해 레포트 형태로 제공해 주어 간단한 조작으로 유전체 변이 분석 결과를 한눈에 확인할 수 있게 하는 단세포 기반의 암 유전체 분석 자동화 장치 및 방법을 제공한다. 또한, 본 발명은 혈액을 이용해 더 정확한 암 변이 분석을 수행하고, 단세포 기반의 암 분석을 이용하여 암 조직의 다양한 위치에 대해 세포 수준의 해상도로 이질성을 분석할 수 있는 단세포 기반의 암 유전체 분석 자동화 장치 및 방법을 제공한다.본 발명에 따르면, 게놈 분석을 수행하는 분석 파이프라인들의 실행을 자동화하여 사용자들이 분석 작업을 효율적으로 수행할 수 있게 하고, 또한 분석 결과를 웹상에서 GUI를 통해 레포트 형태로 제공해 주어 간단한 조작으로 유전체 변이 분석 결과를 한눈에 확인할 수 있게 하는 효과를 얻을 수 있다. 또한, 본 발명은 혈액을 이용해 더 정확한 암 변이 분석을 수행하고, 단세포 기반의 암 분석을 이용하여 암 조직의 다양한 위치에 대해 세포 수준의 해상도로 이질성을 분석할 수 있는 효과를 얻을 수 있다.