엔진(12), 상기 엔진과 상류측에서 소통하는 유입 서브시스템(14), 상기 엔진과 하류측에서 소통하는 배기  서브시스템(16), 터보차저 터빈(38) 상류측과 터보차저 압축기(28) 하류측의 상기 배기  및 유입 서브시스템들 사이에 배치된 고압 EGR 통로(46), 및 상기 터보차저 터빈 하류측과 상기 터보차저 압축기(28) 상류측의 상기 배기  및 유입 서브시스템들 사이에 배치된 저압 EGR 통로(48)를 포함하는 터보차지되는 압축 착화 엔진 시스템(10)에서 배기 가스 재순환(EGR)을 제어하는 방법이 개시된다. 배기가스 배출  기준들을 따르는 목표 총 EGR율이 결정된 후, 상기 결정된 목표 총 EGR율의 제한범위 내에서 다른 엔진 시스템 기준들을 최적화하도록 목표 HP/LP EGR비가 결정된다.